全国首个百纳秒级蛋白小分子动态构象数据集上线“智爱赛思”科学智能开放社区

数据规模:
超一万套体系,两档时长全覆盖,持续生产中
依托自主研发的天穹3D科学计算机,思朗科技构建了这一动态构象数据库:其中四千套体系完成500纳秒分子动力学模拟,六千套完成100纳秒模拟,累计模拟时长约2.6毫秒。数据集仍在持续生产,规模与覆盖还将继续增长。本次在智爱赛思社区平台首批开放其中50套代表性体系,供学术界与产业界参考、使用;其余数据可通过与思朗科技洽谈合作的方式按需获取。由此,数据集既保证了开放共享的公益性,也为后续深度合作与定制化生产预留了空间。

【图2:智爱赛思社区平台数据集详情页】
模拟时长:
100~500纳秒两档长时动力学,纳秒级密度连续采样
长时程,是这批数据真正的壁垒,也是它与既有公开数据最本质的区别。此前国内外已公开的蛋白–小分子动力学数据集,单条轨迹时长多在10纳秒量级,或依赖增强采样得到加速短轨——看得见“结合的瞬间”,却看不清“结合的过程”。结合本不是一个瞬间,而是配体在口袋中驻留、重取向、局部逃逸,以及蛋白柔性、口袋开合与界面重排共同演化的过程。
100~500纳秒的长时程连续观测,使这些微观事件不再被截断为短轨迹中的偶然片段,而成为可统计、可比较、可建模的时间结构。由此,数据不再只服务于结构展示,而能够支撑亲和力预测、结合稳定性评估、动态口袋与隐秘位点发现,并为微观世界模型提供高保真的物理过程监督:让模型学习的不是“分子看起来像什么”,而是“相互作用如何随时间发生”。
围绕这批数据,思朗科技建立了一套从生产到交付的完整标准:所有模拟都在“天穹”3D科学计算机上自动完成,产出的每一条轨迹都经过严格的质量检验,并以统一、规范的格式交付科研人员拿到手,无需额外处理,就能直接用于AI模型训练,打通从科学计算到人工智能之间的“最后一公里”。
应用场景:
从“看见结合”走向“理解、预测、生成结合”
这一发布的意义,不在于再增加一套结构库,而在于把我国AI for Science的数据底座,从静态坐标推进到动态物理过程。当亲和力、稳定性、口袋演化与微观世界模型开始共享同一套长时程、可溯源、可治理的动态构象,智能药物设计才真正具备从“看见结合”走向“理解结合、预测结合、生成结合”的基础。
此次蛋白小分子动态构象数据集登陆智爱赛思社区平台,是国产科学计算算力与AI4S数据基础设施底座的一次深度协同。未来,思朗科技将持续扩充动态构象数据库规模,并与上海仪电等生态伙伴深化合作,共同夯实面向科学智能的动态数据底座,助力AI for Science从模型创新走向规模化产业应用
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关于我们 / About us
思朗科技成立于2016年,是一家深耕于科学智能的高科技半导体独角兽企业,团队脱胎于中国科学院自动化研究所,致力于国产高性能算力芯片的设计和应用,为科学智能提供自主可控的算力基础设施和行业高质量科学数据集。
作为自主创新架构先行者,思朗科技拥有万亿次代数运算微处理器MaPU的完整自主知识产权。MaPU架构凭借创新的指令集架构、处理器、计算体系架构,完美融合了ASIC的高效性以及CPU/GPU的灵活可编程性优势,是通用计算架构领域的一次重大创新发明。
基于MaPU架构,思朗科技自主研制核心产品“天穹”3D科学计算机,作为软硬协同的科学智能基础设施,拥有全球范围内罕见的微秒级长时间尺度、百万原子级高精度模拟能力,正在源源不断地面向科学智能核心领域提供澎湃算力。
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